近日,西南大学农学与生物科技学院薯类团队在The Plant Journal上在线发表了题为“Comprehensive transcriptional regulatory networks in potato through chromatin accessibility and transcriptome under drought and salt stresses”的研究论文,本文构建了不同胁迫处理、处理时间及不同组织下的特异和共享转录调控网络,为阐明马铃薯对干旱、盐胁迫特异性响应机制以及对干旱、盐胁迫协同响应提供了研究基础。
干旱和盐胁迫会严重影响马铃薯生长发育,导致产量和品质大幅降低。然而,马铃薯对盐旱胁迫的特有或共有调控网络尚未得到解析。在本研究中,团队利用ATAC-seq和RNA-seq技术联合分析了染色质可及性与基因转录表达关系,构建了不同胁迫持续时间(3 h和 48 h)、不同组织(叶片和根)以及不同胁迫(干旱和盐)之间特有和共有的转录调控网络。这是首次以不同胁迫和组织为分析点,研究马铃薯胁迫响应机制的特性与共性,为全面解析马铃薯盐旱胁迫响应机制提供了理论基础。

吕典秋教授为该研究的通讯作者,荐红举副教授为共同通讯作者,2023级博士研究生文诗琪为第一作者。本研究由国家自然科学基金(32101659)、国家重点研发计划(2022YFD1201600)、重庆市技术创新与应用发展专项(CSTB2022TIAD-CUX0012)及重庆市现代农业产业技术体系等项目资助(CQMAITS202303)。
论文链接:https://doi.org/10.1111/tpj.70081